A avaliação da aprendizagem do aluno é realizada pela observação contínua dos registros de trabalhos individuais e em grupos. Em todos os processos e métodos aplicados para a avaliação do aproveitamento, os aspectos qualitativos preponderam sobre os quantitativos. O sistema de avaliação do Colégio Unesc é diferenciado por englobar, além da aprendizagem do aluno, também a prática pedagógica e a ação educativa da escola. Com base nos pressupostos filosóficos do colégio, educadores, pais e alunos avaliam as ações do Colégio Unesc e a prática do próprio professor.
O resultado das avaliações dos alunos é definido por nota e conceito:
No Ensino Fundamental I são atribuídos conceitos:
A - Atingiu
P - Atingiu Parcialmente
N - Não Atingiu
No Ensino Fundamental II e nas séries do Ensino Médio, são atribuídas notas de 1,00 a 10,00 ao aproveitamento.