O Instituto de Alimentos tem como finalidade prestar serviços para análises de alimentos e contribuir nas inspeções e fiscalizações dos órgãos públicos, tais como a Companhia Integrada de Desenvolvimento Agrícola de Santa Catarina (Cidasc) e o Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA).
O IALI está apto a realizar análises microbiológicas, físico-químicas e bromatológicas. Atua também na área de pesquisa e desenvolvimento de produtos, no aperfeiçoamento de processos e, ainda, no diagnóstico da saúde animal.