No início de 1999, foi dado o primeiro passo em direção ao estabelecimento do Laboratório de Geoinfomação Aplicada. A solicitação era dos cursos de Geografia e Agrimensura, que indicavam a sua criação como um fator preponderante ao reconhecimento do primeiro e reavaliação do segundo.

O espaço físico foi alocado no IPAT, funcionando até 2001, em apoio à disciplina de Iniciação ao Geoprocessamento, bem como à prestação de serviços.

Com a inauguração do Bloco XXI-C - construído com a finalidade de centralizar a área de informática - o laboratório passou a ocupar a sala 10, sendo para lá transferidas suas estruturas de hardware e software. Os demais equipamentos foram alocados: parte no Laboratório de Geociências do Curso de Geografia e parte no Laboratório de Topografia do Curso de Engenharia de Agrimensura.

O laboratório possui 24 computadores, como diversos softwares instalados como: GvSIG, Quantum GIS (1.5.0), IrfanView, Google Earth, Tg98 SE, Carta Linx, Arc Gis e Spring. Possui também vários mapas e fotos aéreas, disponibilizados para consulta e empréstimos.